Wetenschappelijk medewerker in onderzoeksproject FunDive

Over de functie

Binnen het internationale onderzoeksproject FunDive zoeken we een wetenschappelijk medewerker met expertise in mycologie, moleculaire ecologie en bio‑informatică. De opdracht duurt vier maanden en richt zich op de analyse van long‑read metabarcoding‑datasets en het afronden van wetenschappelijke manuscripten.

Belangrijkste verantwoordelijkheden

• Uitvoeren van bio‑informatische en statistische analyses van omvangrijke metabarcoding‑datasets, inclusief kwaliteitscontrole, taxonomische annotatie en ecologische interpretatie.
• Ontwikkelen, onderhouden en documenteren van reproduceerbare analyse‑workflows in R, Bash en Python binnen een Linux/HPC‑omgeving.
• Schrijven en finaliseren van twee wetenschappelijke manuscripten voor internationale peer‑review tijdschriften.
• Uitvoeren van gericht mycologisch veldwerk en organiseren van een Engelstalig webinar over het project.

Gewenst profiel

• Masterdiploma in biologie of een gelijkwaardige richting, bij voorkeur met specialisatie in (moleculaire) mycologie.
• Aantoonbare onderzoekservaring in mycologie, taxonomie, ecologie en biodiversiteit van macrofungi, ondersteund door publicaties of projecten.
• Diepgaande kennis van DNA‑metabarcoding en long‑read sequencing (Oxford Nanopore, PacBio, Illumina, AVITI).
• Ervaring met taxonomische annotatie met referentiedatabanken zoals UNITE of EUKARYOME.

Vereiste vaardigheden

• Programmeervaardigheden in R, Bash en Python.
• Ervaring met Linux/HPC‑omgevingen en versiebeheer (Git).
• Multivariate statistiek en ecologische gemeenschapsanalyse.
• Gebruik van containertechnologieën (bijv. Apptainer).